A 3ª Divisão era chamada de 1ª Divisão Módulo Especial.
Angra dos Reis, campeão, e Everest, vice, foram promovidos ao Campeonato Estadual da 2ª Divisão de 2000.
O Internacional FC não disputou a compeitção e acabou rebaixado para a 4ª divisão de 1999. O Internacional mudaria de nome para Universal FC.
Os Participantes
- Angra dos Reis EC
- CE Arraial do Cabo
- UE Coelho da Rocha (São João de Meriti)
- AA Colúmbia (Duque de Caxias)
- Everest AC (Rio de Janeiro)
- Paratiense (Paraty)
- Raíz da Gávea (Rio de Janeiro)
- Rodoviário (Barra do Piraí)
- São João de Meriti Taquaral (Maricá)
- Tupy (Paracambi)
- União Central (Rio de Janeiro)
- União de Marechal Hermes (Rio de Janeiro)
1ª Fase
1ª Rodada
20/06/1999
- Angra dos Reis 1-0 Tupy
- Rodoviário 1-1 Paratinense
- Coelho da Rocha 0-1 Everest
- Arraial do Cabo 2-0 Taquaral
- São João de Meriti 1-4 União de Marechal Hermes
23/06/1999
- Raíz da Gávea 1-1 União Central
2ª Rodada
26/06/1999
- Arraial do Cabo 1-0 União Central
27/06/1999
- Tupy 1-0 Rodoviário
- Angra dos Reis 2-1 Paratinense
- Colúmbia 0-0 São João de Meriti
- União de Marechal Hermes 0-1 Coelho da Rocha
04/07/1999
- Taquaral 2-1 Raíz da Gávea
3ª Rodada
30/06/1999
- São João de Meriti 1-3 Everest
- Colúmbia 1-0 União de Marechal Hermes
4ª Rodada
04/07/1999
- Coelho da Rocha 1-0 São João de Meriti
- Everest 1-1 Colúmbia
5ª Rodada
10/07/1999
- Rodoviário 0-1 Angra dos Reis
11/07/1999
- Paratinense 0-2 Tupy
- Colúmbia 1-0 Coelho da Rocha
- União de Marechal Hermes 0-0 Everest
- Raíz da Gávea 1-1 Arraial do Cabo
- União Central 0-3 Taquaral
6ª Rodada
17/07/1999
- Taquaral 0-2 Arraial do Cabo
- União Central 0-0 Raíz da Gávea
18/07/1999
- Tupy 1-1 Angra dos Reis
- União de Marechal Hermes 1-0 São João de Meriti
- Paratinense 0-1 Rodovário
- Everest 0-0 Coelho da Rocha
7ª Rodada
24/07/1999
- Arraial do Cabo 0-1 União Central
25/07/1999
- Rodoviário 1-1 Tupy
- Angra dos Reis 2-0 Paratinense
- São João de Meriti 1-0 Colúmbia
- Coelho da Rocha 2-1 União de Marechal Hermes
- Raíz da Gávea 1-0 Taquaral
8ª Rodada
28/07/1999
- Everest 2-0 São João de Meriti
- União de Marechal Hermes 1-1 Colúmbia
9ª Rodada
01/08/1999
- Colúmbia 0-0 Everest
- Angra dos Reis 3-1 Rodovário
- Tupy WO-0 Paratinense (2-0)
- Arraial do Cabo 1-1 Raíz da Gávea
- Taquaral 1-1 União Central
- São João de Meriti 0-0 Coelho da Rocha
10ª Rodada
08/08/1999
- União de Marechal Hermes 0-1 Everest
- Colúmbia 1-2 Coelho da Rocha
Classificação
Grupo A
- 1º Angra dos Reis - 16 - 2ª Fase.
- 2º Tupy - 11 - 2ª Fase.
- 3º Rodoviário - 5
- 4º Paratinense - 1
Grupo B
- 1º Everest - 16 - 2ª Fase.
- 2º Coelho da Rocha - 14 - 2ª Fase.
- 3º Colúmbia - 10 - 2ª Fase.
- 4º União de Marechal Hermes - 8
- 5º São João de Meriti - 5
Grupo C
- 1º Arraial do Cabo - 11 - 2ª Fase.
- 2º Raíz da Gávea - 7 - 2ª Fase.
- 3º Taquaral - 7 - 2ª Fase.
- 4º União Central - 6
2ª Fase
1ª Rodada
15/08/1999
- Taquaral 0-0 Raíz da Gávea
- Colúmbia 0-3 Angra dos Reis
- Tupy 0-0 Everest
- Coelho da Rocha 1-0 Arraial do Cabo
2ª Rodada
22/08/1999
- Angra dos Reis 3-0 Taquaral
- Raíz da Gávea 0-1 Colúmbia
- Arraial do Cabo 0-0 Tupy
- Everest 2-0 Coelho da Rocha
3ª Rodada
29/08/1999
- Taquaral 0-1 Colúmbia
- Angra dos Reis 3-0 Taquaral
- Tupy 0-0 Coelho da Rocha
- Arraial do Cabo 2-1 Everest
4ª Rodada
05/09/1999
- Everest 1-1 Tupy
- Arraial do Cabo 0-0 Coelho da Rocha
- Angra dos Reis 2-1 Colúmbia
- Raíz da Gávea WO-0 Taquaral
5ª Rodada
12/09/1999
- Tupy 0-0 Arraial do Cabo
- Coelho da Rocha 0-0 Everest
- Taquaral 0-WO Angra dos Reis (0-2)
- Colúmbia 1-2 Raíz da Gávea
6ª Rodada
19/09/1999
- Coelho da Rocha 0-3 Tupy
- Everest 3-0 Arraial do Cabo
Jogo Cancelado
- Colúmbia - Taquaral
- Raíz da Gávea - Angra dos Reis
Classificação
Grupo 1
- 1º Angra dos Reis - 15 - Final.
- 2º Raíz da Gávea - 7
- 3º Colúmbia - 6
- 4º Taquaral - 1
Obs: O Taquaral foi suspenso pela federação.
Grupo 2
- 1º Everest - 9 - Final.
- 2º Tupy - 8
- 3º Arraial do Cabo - 6
- 4º Coelho da Rocha - 6
Final
26/09/1999
- Angra dos Reis ** 2-0 Everest
A Campanha
1ª Fase
- 1-0 Tupy - c
- 2-1 Paratinense - c
- 1-0 Rodoviário - f
- 1-1 Tupy - f
- 2-0 Paratinense - f
- 3-1 Rodoviário - c
2ª Fase
- 3-0 Colúmbia - f
- 3-0 Taquaral - c
- 3-0 Raíz da Gávea - c
- 2-1 Colúmbia - c
- WO-0 Taquaral - f (2-0)
- - Raíz da Gávea - f (cancelado)
Final
- 2-0 Everest - c
Classificação
- 1º Angra dos Reis - Campeão + 2ª Divisão.
- 2º Everest - 2ª Divisão.
- 3º Tupy
- 4º Raíz da Gávea
- 5º Colúmbia
- 6º Arraial do Cabo
- 7º Coelho da Rocha
- 8º Taquaral
- 9º União de Marechal Hermes
- 10º União Central
- 11º Rodoviário
- 12º São João de Meriti
- 13º Paratinense