Ele só jogou pelo Botafogo e pela seleção brasileira. No Glorioso foram 721 partidas. Pelo Brasil fora quatro Copas do Mundo: 1950, 1954, 1958 e 1962.
O Botafogo homenageou o craque ao batizar seu estádio com o nome de Nílton Santos.
Os Títulos de Nílton Santos no Botafogo
- Torneio Rio-São Paulo de 1962 e 1964.
- Campeonato Estadual de 1948, 1957, 1961 e 1962.
- Torneio Início de 1961, 1962 e 1963.
- Torneio Municipal de 1951.
- Torneio Triangular de Porto Alegre de 1951.
- Torneio Internacional da Colômbia de 1960.
- Torneio de San José de 1961.
- Torneio Pentagonal do México de 1962.
- Torneio de Paris de 1963.
- Torneio Governador Magalhães Pinto de 1964.
- Torneio Jubileu de Ouro da Associação de Futebol de La Paz de 1964.
- Torneio de Paramaribo de 1964.